Comme conséquence directe de l'obstruction des voies aériennes liée à l'apnée du sommeil, le taux de gaz carbonique dans le sang augmente et le taux d’oxygène diminue en proportion de la sévérité de l’obstruction des voies aériennes.
Ces troubles respiratoires sont à l‘origine d’une désorganisation du sommeil, d’une augmentation de la fatigue matinale,d'une
somnolence diurne, d’une moindre facilité à se concentrer, d’une augmentation de l’irritabilité et de maux de tête matinaux.
Globalement, ces patients sont très fatigués et ont du mal à « récupérer » durant leur sommeil. Les conséquence de l’apnée du sommeil sont notamment les effets cardio-vasculaires secondaires à l’obstruction des voies aériennes, menant à une plus grande fréquence des infarctus du myocarde et des accidents vasculaires cérébraux (hémi- ou paraplégies, etc,).
Prés de 25% des patients hypertendus ont un SAS, et on estime que le risque d’infarctus est huit à dix fois plus important chez les apnéiques.